DIGITALNA ARHIVA ŠUMARSKOG LISTA
prilagođeno pretraživanje po punom tekstu
| ŠUMARSKI LIST 1-2/2007 str. 21 <-- 21 --> PDF |
D. Ballian, F. Bogunić, M. Konnert, H. Kraigher, M. Pučko, G. Božič: GENETIČKA DIFERENCIRANOST . Šumarski list br. 1–2, CXXXI (2007), 13-24 Najveći udio u raznolikosti kod subpopulacije Igman – A daje lokus Got-C sa 70,71 %, dok kod Igman – B subpopulacije gen lokus Mnr-A sa veličinom od 79,21 % i Got-C sa 79,19 %. Koeficijent inbreedinga (Fis): Za provjeru kako se u subpopulacijama ponašaju frekvencije genotipova kod promatranih lokusa i frekvencije alela, prikazali smo prema HWE, te uporabili Likelihood ratio test za HWE u programu POPGENE 32. Nulta hipoteza koju testiramo je da je veza između gameta slučajna. Provjerom HWS-a izdvajamo lokuse prema značajnosti u svakoj od subpopulacija uporabom simbola. Tablica 3. Precizni Hardy-Weinbergov test vjerojatnosti Table 3 Likelihood ratio exact test for HWE Gen lokusi Igman – A Igman -B Mh-A ns *** Idh-B -Mdh- A -Gdh- A -Mdh- B ns ns Mdh-C ns ns Lap-B ns ns Got-A ns ns Got-B ns ns Got-C ns ns Pgm-A ns ns Pgi-B ns ns Skdh-A ns ns 6Pgdh-B ns ns 6Pgdh.C ns ns Fest-B ns ns Mnr-A ns ** Mnr-C * ns Aco-A * ns 6Pgdh-A ns ns Subpop. Analizirane subpopulacije smreke * p < 0,05 ** p < 0,01 p < 0,001 ns. p 3 0,05 (niska razina razlika) - Nije provedeno testiranje (jedan od genskih lokusa je monomorfan te testiranje nije moguće) Na temelju dobivenih rezultata, primjetno je značajno odstupanje frekvencija genotipova prema HWE kod lokusa: Mnr-C i Aco-A (za Igman – A), te Idh-A i Mnr-A (za Igman – B) (Tablica 3). Na temelju dobivenih rezultata došli smo i do ocjene koeficijenta inbridinga prema Wrightu, te se subpopulacije razlikuju prema učestalosti pojavljivanja heterozigotnosti u njima, a što je izravna posljedica panmiksije (HWE) (Tablica 4). Tablica 4. Fiksacijski indeks (Fis) Table 4 Fixation indeks (Fis) Gen lokusi Igman – A Igman -B Mh-A -0,0373 1,0000 Idh-B -- Mdh-A -- Gdh-A -- Mdh-B -0,0204 -0,0239 Mdh-C -0,0753 -0,0417 Lap-B -0,0352 -0,0582 Got-A -0,0204 -0,0101 Got-B -0,0101 -0,0101 Got-C 0,1811 0,1974 Pgm-A -0,0309 -0,0309 Pgi-B -0,1036 0,0502 Skdh-A -0,0939 -0,1152 6pgdh-B -0,2483 -0,0062 6pgdh.C -0,0110 -0,2500 Fest-B 0,1304 -0,0858 Mnr-A -0,1667 -0,4780 Mnr-C 0,4792 0,1111 Aco-A 0,0439 -0,0654 6Pgdh-A -0,0239 -0,0823 Srednja veličina -0,0025 0,0059 Tablica 5. Test za manjak heterozigota Table 5 F-Stat – Test for heterozygote insufficiency Gen lokusi Igman – A Igman -B k-k-k Idh-A ns Idh-B -Mdh- A -Gdh- A -Mdh- B ns ns Mdh-C ns ns Lap-B ns ns Got-A ns ns Got-B ns ns Got-C ns ns Pgm-A ns ns Pgi-B ns ns Skdh-A ns ns 6Pgdh-B ns ns 6Pgdh.C ns ns Fest-B ns ns Mnr-A ns ns Mnr-C ns ns Aco-A ns ns 6Pgdh-A ns ns Ukupno – Total ns ns Fiksacijski indeks u subpopulaciji Igman – A za 17 polimorfnih lokusa ukupno je -0,0025 te pokazuje da |