DIGITALNA ARHIVA ŠUMARSKOG LISTA
prilagođeno pretraživanje po punom tekstu
| ŠUMARSKI LIST 11-12/2011 str. 16 <-- 16 --> PDF |
O. Tančeva Crmarić, S. Štambuk, Z. Šatović, D. Kajba: GENOTIPSKARAZNOLIKOST DIVLJE TREŠNJE ... Šumarski list br. 11–12, CXXXV (2011), 543-555 550 Izračun genetske udaljenosti (D PSAM ) između genotipova i izrada stabla Proportion of shared allele distances (DPSAM) among genotypes and neighbor-joining tree Prosječna genetska udaljenost izračunata na temelju udjela zajedničkih alela (DPSAM) između 24 genotipa divlje trešnje iznosila je 0,573 (tablica 3). Najmanja je genetska udaljenost (DPSAM = 0,100) zabilježena iz- među genotipova KP2 i KP5 iz regije Koprivnica (DPSAM = 0.1009 koji su se podudarali u 27 od 30 alela, dok je najveća genetska udaljenost (DPSAM = 0,933) za- bilježena između genotipova “Dju2” (Bjelovar) i “L3” (Zagreb) koji su se razlikovali u 28 od 30 alela. Na ne- zakorijenjenom stablu nastalom metodom sparivanja susjeda (Neighbour-Joining) nije primjećeno jasno svr- stavanje jedinki s obzirom na regiju (slika 3).Vrijedno- stiboostrappojedinih skupina na stablu su uglavnom bile niske (<50%). Slika3. Stablo nastalo metodom spariva- nja susjeda (Neighbor-Joining) na temelju matrice genetske udalje- nosti temeljem udjela zajedničkih alela (D PSAM ) između 24 klona divlje trešnje dobivena analizom 15 mikrosatelitnih biljega.Vrijed- nosti pouzdanosti boostrap iznad 50 % prikazane su na granama. Regije su označene bojama: Bje- lovar (zeleno), Koprivnica (pla - vo) i Zagreb (crveno) Figure 3 Neighbor-joining tree based on matrix of proportion of shared al- lele distances (DPSAM) among 24 wild cherry (Prunus aviumL.) clo- nes as obtained by the analysis of 15 microsaellite markers. Boo- strap support values higher than 50 % are given above the branc- hes. Regions are indicated by co- lo urs: Bjelovar (green), Ko pri- vnica (blue), Zagreb (red) Faktorijalna analiza korespondencije (FCA) Factorial correspondence analysis (FCA) Faktorijalna analiza korespondencije (FCA) naprav- ljena pomoću programa Genetix 4,05 (Belkhir i sur. 2004), a provedena je uzimajući u obzir regionalnu pri- padnost jedinki u analizi, i dala je grafički prikaz odnosa između analiziranih klonova divlje trešnje. Na slici 4. pri- kazana je projekcija jedinki i baricentara regija u koordi- natnom sustavu određenom prvim dvjema osima faktori- jalne analize korespondcije (FCA). Prva je os objašnja- vala 63,76 % ukupne inercije, a druga 36,24 %. Prva je os razdvojila jedinke iz regije Zagreb od jedinki iz regije Bjelovar i Koprivnica, dok su se po drugoj osi razdvojile jedinke iz regije Bjelovar od onih iz regije Koprivnica. Tablica 4. Raspodjela mikrosatelitne raznolikosti divlje tre- šnje između i unutar tri regije (Bjelovar, Kopri- vnica, Zagreb) na temelju Analize molekularne varijance (AMOVA) Table 4 Analysis of Molecular Variance (AMOVA) for the partitioning of microsatellite diversity of wild cherry among and within three regions (Bjelovar, Koprivnica, Zagreb) Regija / Bjelovar Koprivnica ZagrebRegion Bjelovar 0.3856 0.0285 Koprivnica 0.0019 0.0038 Zagreb 0.0396 0.0539 Analiza molekularne varijance (AMOVA) Analysis of Molecular Variance (AMOVA) Analizom molekularne varijance (AMOVA) utvrđeno je da je znatno veći postotak (95,88 %) ukupne mikrosate- litne raznolikosti uzrokovan razlikama između jedinki unutar regija od onog uzrokovanog razlikama između re- gija (4,12 %)..-statistika je iznosila 0,041 i bila je viso- kosignifikantna (P < 0,01) što ukazuje na postojanje određene regionalne strukturiranosti genetske raznoliko- sti (tablica 4). Izračunavanjem.ST vrijednosti između pa- rova regija i pripadajućih P-vrijednosti (tablica 5) utvrđeno je da .ST vrijednost između regije Bjelovara i Koprivnice nije bila signifikantna (P> 0,05), dok je iz- među regije Bjelovar i Zagreb bila signifikantna (0,05 < P < 0,01), a između regije Koprivnica i Zagreb visokosigni- fikantna (P< 0,01). |